新冠病毒变异的描绘，上了热搜。
昨日宣布了一篇文章，大约的意思是新冠病毒变异了。
好可怕，这么快就变异了。
新冠病毒变异了么？
2.17
广东省疾控中心剖析了广东和武汉前期的新冠，简直无骤变；
2.19
中科院西双版纳热带植物园剖析了93个样本，发现仅有120个骤变且均匀散布在10个编码区；
2.25
南边医科大学剖析了38株病毒基因序列后合计有117个位点骤变，均匀地散布整个基因组；
3.3
我国疾控中心剖析了120个样本的基因序列，发现基因组中仅有几个骤变，全体骤变程度较低；
而耶鲁大学的流行病学专家Nathan D. Grubaugh专门在Nature Microbiology上宣布谈论文章，指出病毒骤变契合正常流行病学规则，没必要惊惧。
但同样在3月3日，我国科研团队最新发现显现：新冠病毒已于近期产生了149个骤变点，并演化出了两个亚型，分别是L亚型和S亚型。研讨发现，在地域散布及人群中的份额，这两个亚型体现出了很大差异。其间S型是相对更陈旧的版别，而L亚型更具侵略性感染力更强。
天啊，公然新冠病毒够奸刁，才出来2个月，就能够从陈旧民族骤变成侵略性感染性更强的种族了？
咱们又得从头讲讲病毒了。
病毒有多简略？
简略到不太像生命。
其他的生命，哪怕是个单细胞生物，也仍是自力更生，捕捉点光子制作能量啊，找点碳源氮源仿制下命根子（遗传物质）啊，穿件衣服（核蛋白，维护遗传物质）啊，搭个房子（膜蛋白，细胞膜）啊，用小臂膀小腿（鞭毛等）移动移动。可是病毒，这些如同都不需求，基本上除了命根子有必要保住，其他的衣服房子都能够从宿主细胞抢过来后东拼西凑，不具备自主运动才干，也不需求推陈出新，仅有连续的意图便是仿制命根子——这还真应了理查德.道金斯闻名的定论“自私的基因”。
△蓝藻含有叶绿素，可进行光合作用“自给自足”
△病毒：仿制，仿制，再仿制
从遗传物质上分，病毒有两种（假如不算朊病毒的话），DNA病毒和RNA病毒，咱们曾经也讲过，RNA病毒只要一条链，所以愈加随意……（新冠病毒体外究竟活多久，迄今为止我知道的都萍水相逢你）
所以RNA病毒变异很古怪么，真的太普通了。所以除了病毒发作了从S型到L型的骤变之外，另一种呈现S，L两种型别或许的解说是，原本病毒就有多个亚型，存在必定的多样性。
话不多说，咱们看论文。
1
文章标题
On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2.
翻译：新冠病毒的来源和继续演化。
说人话：新冠病毒如同一向在变变变……
文章链接：
https://academic.oup.com/nsr/advance-article/doi/10.1093/nsr/nwaa036/5775463
2
文章状况
3月3日宣布在National Science Review。
说人话：这可是正式宣布，通过同行评议了哈。
3
研讨数据
在GISAID数据库下载了103个新冠病毒基因组序列。
特别引荐：GISAID可是这次大放异彩的在线数据东西，用于急性感染事情中病原演化的展现，网址参阅：
https://www.gisaid.org/epiflu-applications/next-sars-cov2-app/
4
办法学
使用连锁办法对103个新冠病毒基因组做多元化的剖析，判定了高度连锁多态性位点，并对病毒进行分组。
5
首要发现
（1）从103株病毒基因组中共发现149个多态性位点，但绝大多数的新发骤变都是singleton，即只在一株病毒中发作了骤变。通过连锁剖析发现坐落参阅基因组第8782位的T-C同义骤变和28144位的C-T非同义骤变的两个骤变位点高度连锁。
（2） 使用高度连锁的两个位点能够将新冠病毒分为L和S两个亚型，103株病毒中的101株来自这两个亚型。从份额上看，L亚型更为遍及到达70%，S亚型占30%。
（3）通过与其他冠状病毒进行比较，发现S型与蝙蝠冠状病毒在进化上更挨近，或许为先人类型，估测L型则或许由S型演化而来。
6
简评硬核生物信息解读，看不懂能够不看
原本通过对揭露103株新冠病毒基因组数据的整合剖析，判定了149个多态性位点，但其间绝大多数骤变只在某一病毒株中发作，能够供给的信息量有限。作者通过对149个多态性位点的LD剖析判定了两个严密连锁的位点，并将病毒明晰分红两组，尽管从进化树来看，两个分支区别得很清楚，但要是增加PCA和Structure（K=2）的剖析会更让人服气（成果很或许跟预期是共同的）。
别的，进化树上缺少Bootstrap值，要是能够证明一下拓扑结构的健壮性就更好了。尽管从进化树上看，S型比L型更早呈现，但由于基因组数量少，多态性方位信息量有限，现在缺少满足根据证明L型是在S型传达过程中演化出来的仍是两者在本次传达前期一起呈现，至于这两种亚型在传达才干或毒性上是不是真的存在不同，是否受到了天然选择且有功用差异，则需求更多的数据，乃至功用试验来验证。
说人话：这个项意图算法仍是靠谱的，定论也相对明晰，尽管还有前进地步，但确实是通过同行评议的经得住挑刺儿哈。可是仍是由于测序的病毒株有限，样本在时空散布或许仍存在偏倚或许，人群对两种病毒易理性从实践来看也没有显着的不同，无法强力证明是发作了演化，仍是一开始就都存在。
一句话：论据有点少，证明没问题，定论不必定。
题外话，其实文章也有说到，现在的数据量还缺乏，而新冠病毒或许不是新近发作变异而分化成L和S型，而是这两个型别在病毒迸发的前期或许就现已存在，是现在的阻隔和医疗办法把或许更有害的L型频率给降低了。这一成果阐明当时群防群控是行之有效的。仍是媒体招引眼球，又把节奏带偏了……
骤变是病毒生命周期的一个天然组成部分，相似咱们脸上长个痘，或许皮肤上呈现了斑，绝大部分是良性的。关于RNA病毒来说，骤变十分简略，既能够使病毒毒性增强，也可使其削弱。而病毒的毒性和传达方法等是由多个基因操控，换句话说，一般要多个骤变才干发作严重性质改动。而关于骤变结果的说法都需求试验和流行病学依据，咱们不应对病毒一般性骤变感到惊惧。
基因组学科大致将变异分为“骤变”和“基因重组”两种状况。我一向喜爱用扑克牌举例（黑红梅方刚好相当于ATCG），以下相片拍自我家的扑克。
△基因组赌王
比方这副杂色顺子，不管骤变哪一张，都没什么影响，仍是杂色顺子。
但比方这个就不行了，随意拿一张骤变，都不再是最大的同花顺，而变成了杂色顺子，然后能量大大削弱（对病毒来讲，或许就从丧命变成了温文）。
重组的比如，参阅下面这个比如，看似平铺直叙的两副牌，假如交流两张，就变成了两副同花顺，咱们我们能够简略虚拟了解，蝙蝠冠状病毒和猪冠状病毒重组后就产生了能够感染人的新冠病毒。
最终插播一则预告
今天头条在线直播预告
时刻：2020年3月6日20:00
地址：今天头条账号“尹烨”
#头条防疫专家团# #战疫必胜#
通过两期直播，尹哥充沛感触到了我们的热心，以及对新冠的求知欲。现在，国内疫情现已逐步得到操控，而新冠病毒却已悄然在全球延伸开。信任不少小伙伴都想知道，新冠病毒是如安在全球延伸开的？新冠病毒已呈现变异，是更阴险？仍是更奸刁？全球疫苗研制发展怎么？我国是否现已上人体试验了？
